Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms