Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt40Q6IFX3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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