Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Fbxo27Q6DIA9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Fbxo27Q6DIA9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms