Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kdm5dQ62240 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kdm5dQ62240 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms