Protein–RNA interactions for Protein: Q61315

Apc, Adenomatous polyposis coli protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcQ61315 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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ApcQ61315 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ApcQ61315 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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