Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lamb3Q61087 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms