Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Foxd4Q60688 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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