Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pfdn4Q3UWL8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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