Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms