Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms