Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms