Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
V1rd19Q3KNP5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms