Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam178bQ24JP3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Fam178bQ24JP3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam178bQ24JP3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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