Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cers3Q1A3B0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cers3Q1A3B0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms