Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpusd2Q149F1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpusd2Q149F1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms