Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb8Q0VBD0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms