Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms