Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ubxn2bQ0KL01 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms