Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnma1Q08460 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms