Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Tff1Q08423 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tff1Q08423 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tff1Q08423 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tff1Q08423 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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