Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col9a2Q07643 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms