Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
NrepQ07475 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms