Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bp2Q06649 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms