Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms