Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Apoa1Q00623 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms