Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GabpaQ00422 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GabpaQ00422 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms