Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pax8Q00288 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms