Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfi1P70338 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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