Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtnP63089 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PtnP63089 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtnP63089 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtnP63089 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PtnP63089 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms