Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl23aP62751 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms