Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp25P57080 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp25P57080 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms