Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lbx1P52955 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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