Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CcnfP51944 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms