Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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BckdhaP50136 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BckdhaP50136 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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