Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CitP49025 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CitP49025 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CitP49025 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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