Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gli1P47806 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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