Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cdkn1bP46414 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms