Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxd10P28359 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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