Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjc1P28229 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms