Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Psmb9P28076 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Psmb9P28076 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms