Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Znf239P24399 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Znf239P24399 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms