Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms