Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RarbP22605 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RarbP22605 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RarbP22605 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RarbP22605 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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