Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl9P18340 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl9P18340 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms