Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Vpreb1P13372 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms