Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Myod1P10085 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Myod1P10085 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms