Protein–RNA interactions for Protein: P01675

Ig kappa chain V-VI region XRPC 44, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01675 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01675 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01675 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01675 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01675 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01675 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01675 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01675 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01675 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01675 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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