Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01666 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01666 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01666 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01666 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01666 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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