Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P01665 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P01665 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
P01665 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P01665 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
P01665 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms