Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CopeO89079 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CopeO89079 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CopeO89079 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CopeO89079 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms